建国后南通市档案，主要是自1949年以来中共南通市委、 南通市人民政府及其所属各部委办局，企事业单位形成的。这部分档案反映了南通市(1983年地市合并以后包括海安、如皋、如东、南通、启东、 海门县）解放以来机构建立、干部任免、城市建设、工农业生产、文教卫生、交通运输、土改、民主改革、增产节约、“三反”、“五反”、“文革”等方面的情况，是南通市发展历程的真实记载。
迄今为止，这部分档案共有469个全宗，档案1055754卷、315772件。
按档案的门类分：有文书档案、科技档案、专门档案（会计档案、人物档案等）、声像档案、实物档案等等。
按档案的内容分为：
1、综合工作方面:有会议记录；有历届人民代表大会、历年先进集体、先进个人、表彰会、劳模会的材料；有镇反肃反、三反五反、抗美援朝、支前、工业学大庆、农业学大寨等历次的政治运动形成的档案；有工作计划、总结、请示报告、工作简报等。
2、农业生产方面:有关于农业生产、农副产品的征购、收购计划；有关于土地征用、山林、农机、水利、防汛防旱等方面的文件。
3、工业交通基本建设方面:有关于工业、手工业和乡镇企业生产的计划和发展、投资的措施以及管理的方法；有基本建设发展规模和城、乡建设规划；有关于交通运输等方面的文件。
4、财政、税务、金融、商业、贸易、社会保险工作方面:有关于税收、财政开支、资金管理使用以及产、供销、市场调节等方面的文件；有关于计划、统计、物价、审计、粮食、商业、供销等工作方面的文件。
5、政法、治安保卫、人武、民兵工作方面:有关于划定地主、富农、资本家成份；反革命、贪污盗窃和投机倒把的审理结果；有关于公安、检察、法院、司法等工作的规范性文件；有关于人武部划归地方以及民兵建设方面的文件。
6、民政工作方面:有关于社会救济、互助、扶贫、结婚登记、拥军优属、复退安置、义务兵役等方面的文件。
7、文教卫生方面:有关于文化、教育、文物、卫生防疫、计划生育、体育、幼托等工作的方面的文件。
8、组织机构、劳动人事、福利工作方面:有关于机构建撤、干部任免、人事处理、奖励惩罚等方面的文件；有关于工资、劳保福利、劳动保护、劳动力管理的文件；有机构编制、招干、提干、就业、分配、调动、工伤事故、退休、知青、错案复查、职称评定等方面的文件。
9、信访、文书、档案工作方面:有关于人民来信来访接待、处理及文书、档案的管理、保密工作等文件。
10、有关于对台、宗教、侨务等方面的政策。
11、有企事业单位（包括破产企事业单位）形成的各类文件、资料。
12、各个机关、企事业单位的各类会计凭证、帐簿、报表等。
有效地利用档案，为改革开放和经济建设服务，为广大人民群众服务是档案工作的根本目的。南通市建立了档案工作后，就非常重视档案的利用工作。50年代和60年代初，提供利用档案，主要是为机关工作和政治运动服务。党的十一届三中全会后，主要是为落实各项政策，平反冤假错案，解决历史遗留问题服务。改革开放以来，利用档案，开发信息资源，主要是为领导决策提供依据和参考，为经济建设、改革开放、科学研究、编史修志、查证工龄和寻找亲人服务。目前，这部分档案正发挥着巨大的作用，特别是知青档案，为即将退休的知青朋友们提供了证明工龄的依据，解决了知青朋友们的燃眉之急，利用档案产生了显著的社会效益和经济效益，为百姓们解决了诸多的难题。
近年来，档案馆紧跟时代的步伐，进一步拓宽了自己的利用群体，主动出击，由封闭转向开放，由被动转向主动，充分挖掘、利用档案资源服务于社会。通过局馆上下的不懈努力，南通市档案馆成为百姓们解决切身利益的又一个好去处。