南通革命历史档案是1925年至1949年间南通地方党组织、革命武装在革命斗争中所形成的文件材料。共32个全宗，3089卷档案，它反映了南通人民，在党的领导下，同国民党反动派和日本侵略者进行了英勇顽强的斗争，党的组织和广大人民群众在艰苦卓绝的斗争中，所谱写的一部光辉的革命斗争史。而革命历史档案就是这部斗争史的见证和缩影。包括两个部分的档案材料。
第一部分是党组织系统档案。主要有通海区特委、苏中区党委、苏中三、四地委、华中一、九地委各县县委所形成的档案材料。内容有：南通张謇中学地下革命工作者费学华同志的革命活动材料，关于地下党来往信件，解放战争时期南通地下党档案。江苏省委致南通区委及给如皋、海门、启东、海安、崇明县委的指示、信。关于政治与工作斗争形势，目前工作中心与任务、策略。南通县委关于党团组织情况和秘密工作方式。南通武装组织情况，南通工农斗争开展情形、形势与策略。秋收斗争布置，特海区委1、2、3、11号通告。苏中三、四地委关于反“清乡”、反保斗争、粉碎敌伪特工阴谋、锄奸保密工作指示；关于开展对敌斗争建立党的秘密工作等方面的文件。关于扩充武装部队、全面开展游击战的通知。地委、钟、许家屯、谢克、欧阳惠林关于目前形势、任务、指示与报告。关于游击运动反总体战的指示及有关材料，刘瑞龙、欧阳惠林等关于土地改革问题在扩大会议、县委书记联席会议上的讲话。关于土改复查工商业问题的指示、决定、通知。张、钟、谢、白、管、丕、刘关于如皋城接管的情况报告。对县区伪医院接收工作和人员处理问题的补充意见等。
第二部分是政府组织系统档案。主要有苏中三、四专署、苏皖一、九专署、东南行署、通如行署以及各县县政府所形成的档案材料。内容有： 苏中一、三、四、九专署关于干部任免、调备的指令、通令等。关于机构设置、地、县级党政机关编制、组织分工、人员配备、武装登记。关于海安、如皋、蒋政党、特、政权组织、土匪情况调查和关于还乡团与自卫队、顽、特、土匪合流情况的报告。关于政情、暴动、平息情况调查。苏中一专署公安局关于防奸防特、加强武装警察、情报、市镇、惩奸等工作的通知、通报等。
这些革命历史档案中，有反映中国共产党早期党组织在南通活动的情况，有1925年南通建党初期王盈朝给恽代英的信（表示为革命事业献身的决心书）。有记录南通人民在党的领导下，所进行的艰苦卓绝，可歌可泣英勇斗争。有记载1931年前后活跃在南通江海平原上的中国工农红军第十四军与国民党反动派斗争的情况材料；有反映抗日战争时期苏中人民在中国共产党领导下，反日伪“清乡”，反“清剿”斗争史料。有中国共产党领导群众锄奸，积极开展游击战，反伪化反保甲，采取新的斗争策略，击破日伪新的阴谋。有共产党员汤景延受令“投敌”打入敌人内部，配合反“清乡”始末材料。还有解放战争时期震惊全国的“三一八”惨案史料。有反映南通人民同资本家斗争，开展罢工，护厂活动的材料。有反映农民在党的领导下，开展反租反息，进行土改，建立农村革命政权，参军支前等材料。这些革命历史材料，真实地反映了苏中人民在党的领导下所进行革命斗争的真实情况和光辉业绩以及南通地区党的组织由小到大，由弱到强的发展过程。南通革命历史档案，它不仅是史学工作者、党史工作者研究南通地方革命史和党史、军史的第一手资料，它作为南通社会主义精神文明建设的宝贵财富，也是对广大人民群众进行爱国主义教育，尤其是对青少年进行革命传统教育的生动教材。